A Classe 1-A do Colégio UA tem sido o foco de uma quantidade substancial de atenção pública devido aos vários ataques de vilões que enfrentaram no último ano letivo. Essa atenção deixou os rivais da Classe 1-A, Classe 1-B, sentindo-se bastante amargos. Desejando provar suas habilidades, eles aguardam a oportunidade que lhes foi dada: um conjunto de batalhas simuladas entre os alunos de cada turma.

As classes são divididas em esquadrões de quatro, cada um com a tarefa de capturar os membros dos outros grupos. O vencedor é o grupo que captura toda a equipe adversária. Embora pareça simples, um obstáculo é jogado na mistura com a inclusão do estudante do Departamento de Educação Geral Hitoshi Shinsou, que deseja ser transferido para o Departamento de Heróis. Apesar de usar seu treinamento com o professor de classe 1-A Shouta "Eraserhead" Aizawa para provar que ele é capaz de ser um verdadeiro herói, ele ainda está muito atrás dos outros devido à sua falta de experiência. No entanto, Shinsou está determinado a superar esse desafio.

Assim começa a competição acirrada entre as Classes 1-A e 1-B, à medida que cada uma tenta provar que é superior à outra.